Οι κυπριακές ομάδες ήταν οι μεγάλοι κερδισμένοι του Europa League. Ο Απόλλωνας Λεμεσού επικράτησε με 2-1 της Ζελέζνιτσαρ εκτός έδρας και ουσιαστικά εξασφάλισε το εισιτήριο στην επόμενη φάση εκεί που αν περάσει ο Ατρόμητος θα διασταυρώσουν τα ξίφη τους. Ο ΑΠΟΕΛ από την πλευρά του επιβλήθηκε με 5-0 της Φλόρα Ταλίν, ενώ η ΑΕΚ Λάρνακας έμεινε στο 0-0 στην Ιρλανδία με τη Ντάνταλκ.
Σε αυτά τα πρώτα ματς υπήρξαν και εκπλήξεις με την Άλκμααρ να χάνει με 2-0 από την Αλμάτι και η Σλόβαν Μπρατισλάβας έχασε 2-1 από τη Μπάλζαν.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα του 2ου προκριματικού:

Ούφα (Ρωσία) - Ντομζάλε (Σλοβενία) 0-0
Βέντσπιλς (Λετονία) - Μπορντό (Γαλλία) 0-1
Βιτορούλ (Ρουμανία) - Φίτεσε (Ολλανδία) 2-2
Σπάρτακς (Λετονία) - Λα Φιορίτα (Σαν Μαρίνο) 5-0
Καϊράτ Αλμάτι (Καζακστάν) - Άλκμααρ (Ολλανδία) 2-0
Τομπόλ Κοστανάι (Καζακστάν) - Πιουνίκ (Αρμενία) 2-1)
Ρούνταρ (Σλοβενία) - Στεάουα (Ρουμανία) 0-2
Μπαλζάν (Μάλτα) - Σλόβαν Μπρατισλάβας (Σλοβακία) 2-1
Τσιχούρα (Γεωργία) - Μάριμπορ (Σλοβενία) 0-0
Χάποελ Χάιφα (Ισραήλ) - Χαφναρφιόρντουρ (Ισλανδία) 1-1
Τορπέντο Κιουτάισι (Γεωργία) - Βίκινγκουρ (Ισλανδία) 3-0
Ντούντελανζ (Λουξεμβούργο) - Ντρίτα (Κόσοβο) 2-1
Λειψία (Γερμανία) - Χάκεν (Σουηδία) 4-0
ΑΠΟΕΛ (Κύπρος) - Φλόρα Ταλίν (Εσθονία) 5-0
Χόνβεντ (Ουγγαρία) - Προγκρέ (Λουξεμβούργο) 1-0
Τζουργκάρντεν (Σουηδία) - Μαριούπολ (Ουκρανία) 1-1
Μακάμπι Τελ-Αβίβ (Ισραήλ) - Ραντνίτσκι Νις (Σερβία) 2-0
Μόλντε (Νορβηγία) - Λάτσι (Αλβανία) 3-0
ΤΣΣΚΑ Σόφιας (Βουλγαρία) - Αντμίρα (Αυστρία) 3-0
Ζρίνσκι Μόσταρ (Βοσνία) - Βαλέτα (Μάλτα) 1-1
Γιαγκελόνια (Πολωνία) - Ρίο Άβε (Πορτογαλία) 1-0
Σαχτιόρ Σόλιγκορσκ - Λεχ Πόζναν (Πολωνία) 1-1
Ντινάμο Μπρεστ (Λευκορωσία) - Ατρόμητος (ΕΛΛΑΔΑ) 4-3
Νόρντζελαντ (Δανία) - ΑΙΚ Στοκχόλμης (Σουηδία) 1-0
ΛΑΣΚ Λίντσερ (Αυστρία) - Λίλεστρομ (Νορβηγία) 4-0
Τόρσχαβν (Φαρόε) - Μπεσίκτας (Τουρκία) 0-2
Σάντα Κολόμα (Ανδόρα) - Βαλούρ (Ισλανδία) 1-0
Γκενκ (Βέλγιο) - Φόλα Ες (Λουξεμβούργο) 5-0
Γκόρνικ (Πολωνία) - Τρεντσίν (Σλοβακία) 0-1
Χάιντουκ (Κροατία) - Σλάβια Σόφιας (Βουλγαρία) 1-0
Ολύμπια Λιουμπλιάνα (Σλοβενία) - Κρουσέιντερς (Β.Ιρλανδία) 5-1
Σουτιέσκα (Μαυροβούνιο) - Άλασκερτ (Αρμενία) 0-1
TNS (Ουαλία) - Λίνκολν (Γιβραλτάρ) 2-1
Σεντ Γκάλεν (Ελβετία) - Σάρπσμποργκ (Νορβηγία) 2-1
Αταλάντα (Ιταλία) - Σαράγεβο (Βοσνία) 2-2
Παρτιζάν (Σερβία) - Τράκαι (Λιθουανία) 1-0
Ζελέζνιτσαρ (Βοσνία) - Απόλλων Λεμεσού (Κύπρος) 1-2
Αμπερντίν (Σκωτία) - Μπέρνλι (Αγγλία) 1-1
Ντάνταλκ (Ιρλανδία) - ΑΕΚ Λάρνακας (Κύπρος) 0-0
Σπάρτακ Σουμπότιτσα (Σερβία) - Σπάρτα Πράγας (Τσεχία) 2-0
Χιμπέρνιαν (Σκωτία) - Αστέρας Τρίπολης (ΕΛΛΑΔΑ) 3-2
Όσιεκ (Κροατία) - Ρέιντζερς (Σκωτία) 0-1
Ντουνάισκα Στρέντα (Σλοβακία) - Ντινάμο Μινσκ (Λευκορωσία) 1-3
Στιάρναν (Ισλανδία) - Κοπεγχάγη (Δανία) 0-2