Η Κορινθος 2006 προκρίθηκε στο επομενο γύρο χωρις ματς. Τα ζευγάρια της δεύτερης φάσης του Κυπέλλου Ελλάδος

 

Το μεσημέρι της Δευτέρας πραγματοποιήθηκε η κλήρωση της β' φάσης του Κυπέλλου Ελλάδος με τη συμμετοχή και πάλι ομάδων από τη Γ' Εθνική αλλά και περσινών κατόχων του Κυπέλλου Ερασιτεχνών.
Από την κλήρωση προέκυψαν πέντε ζευγάρια όπου πέντε ομάδες θα περάσουν στην επόμενη φάση ενώ έντεκα ομάδες προκρίθηκαν χωρίς ματς. Όλα τα παιχνίδια της δεύτερης φάσης θα πραγματοποιηθούν στις 5 Σεπτεμβρίου.
Τα ζευγάρια της α' ζώνης:
Αναγέννηση Πλαγιάς - Θεσπρωτός
Μέγας Αλέξανδρος Τρικάλων - Γιαννιτσά
Ερμής Αμυνταίου - Οικονόμος Τσαριτσάνης
Χωρίς αγώνα προκρίνονται οι:
Απόλλωνας Παραλιμνίου, Άρης Αβάτου, Νίκη Βόλου, Τηλυκράτης Λευκάδας, Α.Ο. Καρδιάς.
Τα ζευγάρια της β' ζώνης:
Αντίμαχος - με το νικητή του Διαγόρας Βραχνεϊκών - Αιολικός
Επισκοπή - Παλληξουριακός
Χωρίς αγώνα προκρίνονται οι:
ΟΦ Ιεράπετρας, Ερμιονίδα, Κόρινθος 2006, Θύελλα Καμαρίου, Νικητής του αγώνα, Κιθαίρων Καπαρελίου - Πανσαμιακός, Εθνικός Πειραιά.
Οι νικητές των αγώνων που θα πραγματοποιηθούν στις 5 Σεπτεμβρίου μαζί με αυτούς που πέρασαν στην επόμενη φάση χωρίς να αγωνιστούν, θα αντιμετωπίσουν στην έδρα τους στον επόμενο γύρο ομάδες της Football League.